В 1990-х годах на Телецком озере геологи и гидробиологи России, Бельгии, США провели обширные исследования: спутниковое наблюдение, детальная картография, компьютерное моделирование геопроцессов, инструментальные измерения, эхолокация дна озера, добыча кернов при донном бурении. На основе собранных данных учены сделали вывод, что котловина озера образовалась в результате бурных тектонических процессов.