Основная версия происхождения озера – тектонический разлом.
В 1990-х годах на Телецком озере геологи и гидробиологи России, Бельгии, США провели обширные исследования: спутниковое наблюдение, детальная картография, компьютерное моделирование геопроцессов, инструментальные измерения, эхолокация дна озера, добыча кернов при донном бурении. На основе собранных данных учены сделали вывод, что котловина озера образовалась в результате бурных тектонических процессов.

Вот что пишет исследователь Телецкого озера, заслуженный метеоролог России, географ-озеровед Валентин Васильевич Селегей: «Новейшие исследования Байкальского и Телецкого рифтов (тектонических разломов) позволяют со значительной долей научного оптимизма утверждать: геологическое и гидробиологическое настоящее Телецкого озера – это далёкое прошлое Байкала. Возраст Байкала – 25-30 млн. лет, а Телецкого озера – менее 1 млн. Телецкое озеро сегодня – это Байкал в далёком геологическом прошлом».

Геологи отмечают на отвесных скалах левого берега южной части озера хорошо заметные «ступени» из песчано-галечных отложений. Высота таких «ступеней» 8 – 20 метров. Это значит, что в прошлом водная поверхность Телецкого озера была выше сегодняшней приблизительно на 180 метров. И похоже, уровень воды упал очень резко. Из-за тектонического движения горных масс в пролом хлынул поток воды. Его сила была такова, что он перетаскивал громадные камни на далекие расстояния. Этим ученые объясняют возникновение каменных порогов на реке Бие.

В начале XX века ученые выдвигали теорию о том, что озеро появилось в результате выпаривания ледника в речной долине. Но научные экспедиции в 1960-х и 1990-х годах эти предположения не подтвердили. Ученые доказали, что котловина озера существовала до того, как Чулышманский ледник двигался через долину. Поэтому если ледник и принимал какое-то участие в формировании озера, то оно было лишь вторичное и поверхностное.

На Алтае прошли четыре ледниковых эпохи.

В эпоху первого оледенения Телецкое озеро представляло собой еще слабо выраженную котловину, и ледники не повлияли на строение озера.

Вторая ледниковая эпоха оставила так называемые троги (широкие корытообразные долины). Ванна Телецкого озера располагается на месте гигантского трога, шириной около 10 километров, остатки которого сохранились вдоль западного склона Прителецких гор на высоте 1600—2000 метров.

Третья ледниковая эпоха совпала с интенсивными тектоническими процессами, когда Алтай приподнялся на 1000—1200 метров, а впадина Телецкого озера углубилась. Узкие и глубоко прорытые речной водой каньоны были преобразованы во время оледенения движущимися по ним льдами в троги. По этим трогам теперь протекают реки Чулышман, Башкаус, Кыга и другие.

Ванна Телецкого озера была последний раз заполнена льдами около 150 тысяч лет тому назад. Из телецкой котловины древний ледник выползал в долину реки Бии, где оставил свои плохо сохранившиеся морены.

В эпоху последнего (четвертого) оледенения ледники не доходили до ванны Телецкого озера и, таким образом, не могли оказать на нее какого-либо влияния.

Фото с ресурса: https://u-f.ru/

Это еще одна версия происхождения озера. Вода вымыла в горной породе большие участки, образовав воронки, пещеры и собственно озеро.
Хотя ученые находят подтверждения того, что котловина Телецкого озера размывалась грунтовыми водами, все же это не главная причина ее возникновения. Известняка в горных хребтах совсем немного, в основном они состоят из твердых пород. Например, горный массив Алтын Ту состоит из гранитов, а мыс Ажи - мраморный.
Грунтовые воды не смогли бы размыть трещину такой огромной глубины и протяженностью порядка 80 км.

Фото с ресурса: gmsn-ural.ru

свяБерега Телецкого озера – большей частью отвесные скалы. Но в одном месте можно встретить оплавленные каменные глыбы, свидетельства космического "гостя".

Происхождение Каменного залива на севере озера, некоторые исследователи связывают с падением метеорита несколько сот лет назад. И хотя залив мог образоваться и от падения в озеро отколовшейся скальной породы, найденные следы оплавления камней больше подтверждают версию упавшего метеорита.

Фото с ресурса: CCO